洗滌塔為氣液逆向接觸的填料吸收塔。含硫沼氣從洗滌塔底部進入與從塔頂進入的堿性循環水(貧液)在洗滌塔填料表面充分接觸，硫化氫等硫化物與堿液發生化學反應，從而達到脫硫的目的，脫硫效果達到99%以上。反應后的循環水(富液)經洗滌塔底部進入到再生反應器。富液中的含硫化合物在再生反應器中經脫硫菌和氧氣的作用下轉變為單質硫，完成貧液再生。再生反應器產生的單質硫混濁液進入沉淀器沉淀，最終通過定期排放排出生物脫硫系統進行回收利用。